Chráněné území se dělí na několik částí, které se rozkládají mezi soutokem Labe s Vltavou. Kromě lužních lesů s převahou dubu letního zde naleznete řadu slepých ramen s výskytem rdestu, voďanky žabí nebo stulíku žlutého, nivní nebo sečené louky. Zajímavostí jsou rozsáhlé populace sněženky, často se vyskytuje rozrazil dlouholistý, dále źluťucha lesklá a vzácný hrachor bahenní.
Přírodní rezervace Úpor – Černínovsko